Detail produktu
SoluProtMutDB
Vznik: 2022
Hamšíková Marie (LL)
Štourač Jan (LL)
Musil Miloš, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT)
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (LL)
Bednář David, Mgr. (LL)
Mazurenko Stanislav, Ph.D. (LL)
stabilní data, proteinové inženýrství, stabilizace proteinů, stabilní mutace
SoluProtMutDB je první databáze obsahující data o změnách rozpustnosti proteinů po mutacích. Naše databáze obsahuje 33 000 měření 17 000 variant proteinů ve 103 různých proteinech. Databáze může sloužit jako základní zdroj informací pro výzkumníky, kteří navrhují vylepšené varianty proteinů, nebo pro ty, kteří vyvíjejí nástroje využívající strojového učení k předpovídání účinků mutací na rozpustnost. Databáze obsahuje všechny dříve publikovaná data o rozpustnosti a tisíce nových datových bodů z nedávných publikací, včetně experimentů se skenováním hlubokých mutací. Navíc obsahuje mnoho dostupných experimentálních podmínek, o kterých je známo, že ovlivňují rozpustnost proteinu. Datové sady byly ručně upraveny s podstatnými opravami, což zlepšilo vhodnost pro aplikace strojového učení. Databáze je dostupná na loschmidt.chemi.muni.cz/soluprotmutdb.
Databáze je zdarma dostupná na https://loschmidt.chemi.muni.cz/soluprotmutdb/.