Detail produktu
FireProt-ASR
Vznik: 2019
Khan Rayyan
Beier Andy, Dr.
Štourač Jan
Konegger Hannes
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (UMEL)
Bednář David
proteinové inženýrství, thermostabiliní proteiny, ancestrální rekonstrukce, evoluční design, stabilita proteinů
FireProt-ASR je webová služba sloužící k plně automatizovanému použití ancestrální rekonstrukce. FireProt-ASR dovoluje uživatelům provést ancestrální rekonstrukci s využitím pouze jediné startovní sekvence. Nástroj nejprve zkompiluje ataset katalyticky relevantních proteinů a tento dataset následně zredukuje na požadovanou velikost biologicky relevantních sekvencí. Sekvence jsou následně zarovnány, je zkonstruován fylogenetický strom a je provedena rekonstrukce ancestrálních uzlů společně s opravou ancestrálních mezer. Uživateli je rovněž dovoleno použít vlastní data a zahájit výpočet z různých částí výpočetního prostředí.
Nástroj je dostupný na internetové adrese: http://loschmidt.chemi.muni.cz/fireprotasr