Detail publikace

Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant

KURUMBANG, N.; DVOŘÁK, P.; BENDL, J.; BREZOVSKÝ, J.; PROKOP, Z.; DAMBORSKÝ, J. Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant. ACS Synthetic Biology, 2014, vol. 3, no. 3, p. 172-181. ISSN: 2161-5063.
Název česky
Počítačové modelování syntetické dráhy pro biodegradaci toxických látek
Typ
článek v časopise
Jazyk
anglicky
Autoři
Kurumbang Nagendra
Dvořák Pavel
Bendl Jaroslav, Ing., Ph.D.
Brezovský Jan
Prokop Zbyněk
Damborský Jiří, prof. Mgr., Dr. (UMEL)
URL
Klíčová slova

aktivita, enantioselektivita, kinetické modelování, proteinové a metabolické inženýrství, syntetická dráha, toxicita

Abstrakt

Antropogenníhalogenované sloučeniny se v přírodě objevily až spříchodem průmyslové revoluce. Mikroorganizmy, které by bylyschopny je přirozeně rozkládat, proto neměly dostatek času kevoluci. Takový problém může být řešen skrze kombinaciproteinového a metabolického inženýrství. V rámci této prácebyla sestrojena syntetická dráha pro konverzi vysoce toxického1,2,3-trichloropropanu naglycerol v organizmu Escheria coli. Optimální poměry enzymů promaximalizaci produkce glycerolu a minimalizace toxicity metabolitůbyly predikovány s využitím matematického modelu. Kmenyobsahující očekávanépoměry enzymů byly zkonstruovány a charakterizovány pro zjištěníjejich viabilitních adegradačních schopností. Bylo dosaženo velmi dobré shody mezipredikovánými a experimentálně zjištěnými daty. Validovanýmodel byl použit ke kvantitativnímu popisu kinetických omezeníkombinací enzymových variant. Nadto tato tudie potvrzuje obecnýpotenciál využitímikroorganizmů prodegradaci toxických antropogenetických sloučenin.

Rok
2014
Strany
172–181
Časopis
ACS Synthetic Biology, roč. 3, č. 3, ISSN 2161-5063
DOI
10.1021/sb400147n
UT WoS
000333476900009
EID Scopus
2-s2.0-84896930502
BibTeX 
@article{BUT133483,
  author="Nagendra {Kurumbang} and Pavel {Dvořák} and Jaroslav {Bendl} and Jan {Brezovský} and Zbyněk {Prokop} and Jiří {Damborský}",
  title="Computer-Assisted Engineering of Synthetic Pathway for Biodegradation of Toxic Persistent Pollutant",
  journal="ACS Synthetic Biology",
  year="2014",
  volume="3",
  number="3",
  pages="172--181",
  doi="10.1021/sb400147n",
  issn="2161-5063",
  url="http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/sb400147n"
}
Soubory
Nahoru