Detail publikace

Clustering of Protein Sequences

RUDOLFOVÁ Ivana a ZENDULKA Jaroslav. Clustering of Protein Sequences. In: Proceedings of 1st International Workshop WFM'06. Přerov: MARQ, 2006, s. 71-78. ISBN 80-86840-20-4.
Název česky
Shlukování proteinových sekvencí
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
angličtina
Autoři
Rudolfová Ivana, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT)
Klíčová slova

proteinové sekvence, optimální yarovnání dvou proteinových sekvencí, konečné automaty, shlukování, podobnostní funkce

Abstrakt

Jednou z metod, jejiž výsledky mohou být využity pro predikci struktury proteinů, je shlukování proteinových sekvencí. Shlukovací metody rozdělují objekty do tříd na základě podobnosti. Podobnost dvou proteinových sekvencí může být určena na základě skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí. Tento článek je zaměřen na využití formálních modelů pro popis problému shlukování proteinových sekvencí. Je zde popsán Needleman-Wunsch algoritmus pro nalezení skóre optimálního zarovnání dvou proteinových sekvencí a konečný automat, který umožní výpočet tohoto skóre.

Rok
2006
Strany
71-78
Sborník
Proceedings of 1st International Workshop WFM'06
Konference
1st International Workshop on Formal Models (WFM'06), Přerov, CZ
ISBN
80-86840-20-4
Vydavatel
MARQ
Místo
Přerov, CZ
BibTeX 
@INPROCEEDINGS{FITPUB8058,
   author = "Ivana Rudolfov\'{a} and Jaroslav Zendulka",
   title = "Clustering of Protein Sequences",
   pages = "71--78",
   booktitle = "Proceedings of 1st International Workshop WFM'06",
   year = 2006,
   location = "P\v{r}erov, CZ",
   ISBN = "80-86840-20-4",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/8058"
}
Nahoru