Detail publikace

Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments

BURGETOVÁ, I.; ZENDULKA, J.; LEXA, M. Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments. In Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010. Lecture Notes in Computer Science. Heidelberg: Springer Verlag, 2010. p. 94-101. ISBN: 978-3-642-15019-7.
Název česky
Shlukování proteinových substruktur pro nalezení nových sekvenčně-strukturních fragmentů
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Burgetová Ivana, Ing., Ph.D. (UIFS)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY)
Klíčová slova

Clustering, density-based clustering, clustering of protein substructures, sequence-structure relationships in proteins

Abstrakt

V této publikaci představujeme novou metodu pro shlukování proteinových substruktur, kterou jsme vyvinuli za účelem studia vztahů meyi proteinovými sekvencemi a jejich strukturou. Jsou zde předloženy výsledky porovnání naší metody s metodou k-medoids. Publikace také obsahuje nástin metody pro hledání sekvenčně-strukturních fragmentů, které se běžně vyskytují v omezením počtu strukturních konformací. Tato metoda využívá prezentovanou sklukovací metodu.

Rok
2010
Strany
94–101
Sborník
Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010
Řada
Lecture Notes in Computer Science
Svazek
6266
Konference
ITBAM 2010, Bilbao, ES
ISBN
978-3-642-15019-7
Vydavatel
Springer Verlag
Místo
Heidelberg
DOI
10.1007/978-3-642-15020-3_9
EID Scopus
2-s2.0-78049470351
BibTeX 
@inproceedings{BUT35834,
  author="Ivana {Burgetová} and Jaroslav {Zendulka} and Matej {Lexa}",
  title="Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments",
  booktitle="Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010",
  year="2010",
  series="Lecture Notes in Computer Science",
  volume="6266",
  pages="94--101",
  publisher="Springer Verlag",
  address="Heidelberg",
  doi="10.1007/978-3-642-15020-3\{_}9",
  isbn="978-3-642-15019-7"
}
Nahoru