Detail publikace

Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments

RUDOLFOVÁ Ivana, ZENDULKA Jaroslav a LEXA Matej. Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments. In: Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010. Lecture Notes in Computer Science, roč. 6266. Heidelberg: Springer Verlag, 2010, s. 94-101. ISBN 978-3-642-15019-7.
Název česky
Shlukování proteinových substruktur pro nalezení nových sekvenčně-strukturních fragmentů
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
angličtina
Autoři
Rudolfová Ivana, Ing., Ph.D. (UIFS FIT VUT)
Zendulka Jaroslav, doc. Ing., CSc. (UIFS FIT VUT)
Lexa Matej, Ing., Ph.D. (UPSY FIT VUT)
Abstrakt

V této publikaci představujeme novou metodu pro shlukování proteinových substruktur, kterou jsme vyvinuli za účelem studia vztahů meyi proteinovými sekvencemi a jejich strukturou. Jsou zde předloženy výsledky porovnání naší metody s metodou k-medoids. Publikace také obsahuje nástin metody pro hledání sekvenčně-strukturních fragmentů, které se běžně vyskytují v omezením počtu strukturních konformací. Tato metoda využívá prezentovanou sklukovací metodu.

Rok
2010
Strany
94-101
Sborník
Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010
Řada
Lecture Notes in Computer Science
Svazek
6266
Konference
International Conference on Information Technology in Bio- and Medical Informatics, Bilbao, ES
ISBN
978-3-642-15019-7
Vydavatel
Springer Verlag
Místo
Heidelberg, DE
DOI
10.1007/978-3-642-15020-3_9
EID Scopus
2-s2.0-78049470351
BibTeX 
@INPROCEEDINGS{FITPUB9338,
   author = "Ivana Rudolfov\'{a} and Jaroslav Zendulka and Matej Lexa",
   title = "Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments",
   pages = "94--101",
   booktitle = "Information Technology in Bio- and Medical Informatics, ITBAM 2010",
   series = "Lecture Notes in Computer Science",
   volume = 6266,
   year = 2010,
   location = "Heidelberg, DE",
   publisher = "Springer Verlag",
   ISBN = "978-3-642-15019-7",
   doi = "10.1007/978-3-642-15020-3\_9",
   language = "english",
   url = "https://www.fit.vut.cz/research/publication/9338"
}
Nahoru