Detail publikace

Utilizing Genetic Programming to Enhance Polygenic Risk Score Calculation

HURTA, M.; SCHWARZEROVÁ, J.; NAGELE, T.; WECKWERTH, W.; PROVAZNÍK, V.; SEKANINA, L. Utilizing Genetic Programming to Enhance Polygenic Risk Score Calculation. In 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2023). Istanbul: Institute of Electrical and Electronics Engineers, 2023. p. 3782-3787. ISBN: 979-8-3503-3748-8.
Název česky
Využití genetického programování k vylepšení výpočtu skóre polygenního rizika
Typ
článek ve sborníku konference
Jazyk
anglicky
Autoři
Hurta Martin, Ing. (UPSY)
Schwarzerová Jana, Ing. et Ing., MSc (UBMI)
Nägele Thomas
Weckwerth Wolfram, Prof., Dr. rer. nat. (UBMI)
Provazník Valentýna, prof. Ing., Ph.D. (UBMI)
Sekanina Lukáš, prof. Ing., Ph.D. (UPSY)
URL
Klíčová slova

Skóre polygenního rizika, genetická variabilita, výpočetní biologie, genetické programování

Abstrakt

Skóre polygenního rizika se v posledních letech v biomedicíně osvědčilo jako cenný nástroj pro hodnocení genetické predispozice jedince k určitému fenotypu (nemoci). Tradiční metody výpočtu polygenního rizikového skóre založené na regresi však mají omezení, která mohou omezovat jejich přesnost a prediktivní sílu. Tato studie představuje inovativní přístup ke zlepšení výpočtu polygenního rizikového skóre pomocí aplikace genetického programování. Využitím síly genetického programování se snažíme překonat omezení tradičních regresních technik a zlepšit přesnost výpočtu skóre polygenního rizika. Konkrétně jsme ukázali, že skóre polygenního rizika generované pomocí kartézského genetického programování poskytuje srovnatelné nebo dokonce robustnější statistické rozlišení mezi skupinami, jak bylo dokázáno v rámci tří nezávislých případových studií.

Rok
2023
Strany
3782–3787
Sborník
2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2023)
Konference
IEEE mezinárodní konference na bioinformatiku a biomedicínu 2023, Istanbul, TR
ISBN
979-8-3503-3748-8
Vydavatel
Institute of Electrical and Electronics Engineers
Místo
Istanbul
DOI
10.1109/BIBM58861.2023.10385615
BibTeX 
@inproceedings{BUT185638,
  author="Martin {Hurta} and Jana {Schwarzerová} and Thomas {Nägele} and Wolfram {Weckwerth} and Valentýna {Provazník} and Lukáš {Sekanina}",
  title="Utilizing Genetic Programming to Enhance Polygenic Risk Score Calculation",
  booktitle="2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2023)",
  year="2023",
  pages="3782--3787",
  publisher="Institute of Electrical and Electronics Engineers",
  address="Istanbul",
  doi="10.1109/BIBM58861.2023.10385615",
  isbn="979-8-3503-3748-8",
  url="https://ieeexplore.ieee.org/document/10385615"
}
Nahoru